芒康滇金絲猴國家級自然保護區(qū)總面積18.53萬公頃，2003年1月經國務院批準為國家級自然保護區(qū)，累計投入建設資金4063.89萬元分三期實施。類烏齊馬鹿國家級自然保護區(qū)總面積120614.6公頃，2005年7月經國務院正式批準建立為國家級自然保護區(qū)，累計投入建設資金7438萬元分四期實施。截至目前，昌都市芒康滇金絲猴國家級自然保護區(qū)三期工程和類烏齊馬鹿國家級自然保護區(qū)四期工程均已完工，正開展竣工驗收工作。

通過完善保護區(qū)管理機構，建設保護與恢復工程、科研與監(jiān)測工程、宣傳與教育工程、基礎設施及附屬工程，初步形成保護為主、宣教結合、防控和發(fā)展于一體的多功能保護區(qū)，積極促進了人與自然和諧發(fā)展，有效保護區(qū)內馬鹿、滇金絲猴、白唇鹿、雪豹、藏雪雞等珍惜瀕危野生動物及高原生態(tài)環(huán)境。